方倉凍干機適合西林瓶裝物料的干燥，凍干準備時，按需要將物料分裝在西林瓶中，浮蓋好瓶蓋后進行冷凍干燥，干燥結束后操作壓蓋機構壓緊瓶蓋，可避免次污染、重新吸附水分，易于長期保存。在干燥室外部接裝燒瓶，對旋凍在瓶內壁的物料進行干燥，這時燒瓶作為容器接在干燥箱外的歧管上，燒瓶中的物料靠室溫加熱，通過多歧管開關裝置，可按需要隨時取下或裝上燒瓶，不需要停機。物料預凍過程，冷阱作為預凍腔預凍物料，在干燥過程，冷阱為捕水器，捕獲物料溢出的水分。帶預凍功能的凍干機，冷凍干燥過程物料的預凍、干燥等均在凍干機上完成，節省了低溫冰箱的費用。
使用方倉凍干機的詳細操作流程如下：
一、樣品擺放：
a、把預處理物品擺放在物料盤中，再將物料盤放到凍干架中。
b、將溫度傳感器放置在任一層物料盤中，測定物料的溫度。
c、將凍干架放入冷阱中，蓋好保溫蓋，準備預凍。
二、樣品預凍：
a、打開設備背部的總電源開關。
b、點擊屏幕中央進入界面，點擊“冰箱”按鈕，開始預凍。建議預凍4小時左右
c、待物品*凍結后，將凍干架從冷阱中取出。
三、樣品干燥：
a、從冷井取出凍干架，將凍干架支撐板放在冷井口，凍干架放在支撐板上，或將料板放在凍干架上，凍干架直接放在冷井上方。
b、將探頭放置到任意一層的物料盤上，罩上玻璃罩。
c、擰緊排水充氣閥門。
d、點擊屏幕上的“真空計”按鈕，屏幕上顯示的真空度為110kpa，然后點擊“真空泵”按鈕啟動真空泵。真空度下降迅速，真空度≤10Pa時正常，正式開始干燥(建議干燥20小時左右，由用戶根據物料含水量的不同而定)。
四、取出樣品：
a、檢查樣品曲線，目測樣品是否*干燥。打開排水充液閥后，點擊“真空泵”按鈕，真空泵停止運行。點擊“真空計”按鈕，真空計關閉。
b、取下玻璃罩，從凍干架上取出料盤，將樣品裝入料盤。單擊“冰箱”按鈕，關閉壓縮機并停止設備。
五、關機操作：
a、關閉總電源開關，整機控制系統斷電。
b、拔下電源插頭、真空泵插頭。
c、用軟布擦拭冷阱、凍干架、托盤及玻璃罩。
d、實驗型真空冷凍干燥機的真空泵在不工作的時候請蓋上排氣孔，防止灰塵進入。
六、排水操作：
a、待冷阱內壁凝結的冰*融化成水后，旋松排水充氣閥，將凝結水排出。