微生物菌種用冷凍干燥機也稱為微生物冷凍干燥機、菌種冷凍干燥機；其作用在于盡可能保持其原有性狀和活力的穩定,確保菌種不死亡、不變異、不被污染,以達到便于研究、交換和使用等諸方面的需要.
微生物菌種用冷凍干燥機原理是用保護劑制備擬保藏菌種的細胞懸液或孢子懸液于安瓿管中,再置入上海拓紛生產的微生物菌種用冷凍干燥機的凍干室內，在低溫下快速將含菌樣凍結,并減壓抽真空,使水升華將樣品脫水干燥,形成完全干燥的固體菌塊.并在真空條件下立即融封,造成無氧真空環境,zui后置于低溫下,使微生物處于休眠狀態,而得以長期保藏.常用的保護劑有脫脂牛奶、血清、淀粉、葡聚糖等高分子物質.
由于此法同時具備低溫、干燥、缺氧的菌種保藏條件,因此保藏期長,一般達5～15年,存活率高,變異率低,是目前被廣泛采用的一種較理想的保藏方法.除不產孢子的絲狀**不宜用此法外,其他大多數微生物如病毒、**、放線菌、酵母菌、絲狀**等均可采用這種保藏方法.但該法操作比較煩瑣,技術要求較高,且需要凍干機等設備.
保藏菌種需用時,可在無菌環境下開啟安瓿管,將無菌的培養基注入安瓿管中,固體菌塊溶解后,搖勻復水,然后將其接種于適宜該菌種生長的斜面上適溫培養即可.